This document specifies a protocol to identify ecotoxicological test specimens (mainly invertebrates and plants) to the species level, based on the DNA barcoding technique. This protocol can be used by laboratories performing DNA barcoding in order to standardize both the wet-lab and data analysis workflows as much as possible, and make them compliant with community standards and guidelines.
This document does not intend to specify one particular strain for each test method, but to accurately document the species/strain which was used.
This document does not aim at duplicating or replacing morphological-based species identifications. On the contrary, DNA barcoding is proposed as a complementary identification tool where morphology is inconclusive, or to diagnose cryptic species, in order to ensure that the results obtained from different ecotoxicological laboratories are referring to the same species or strain.
This document is applicable to identifications of immature forms which lack morphological diagnostic characters (eggs, larvae, juveniles), as well as the streamline identification of specimens collected in field monitoring studies, where large numbers of organisms from diverse taxa are classified.
Dieses Dokument beschreibt ein Protokoll für die Identifizierung ökotoxikologischer Testorganismen (hauptsächlich Invertebraten und Pflanzen) auf Artenebene mit Hilfe des DNA-Barcodings. Dieses Protokoll kann von Labors verwendet werden, die das DNA-Barcoding für die weitgehende Standardisierung des Labor- und Datenanalyse-Workflows einsetzen, damit diese Labors im Einklang mit üblichen Standards und Leitfäden arbeiten.
Dieses Dokument soll keinen bestimmten Stamm für jedes Prüfverfahren, sondern das präzise Dokumentieren der verwendeten Arten/Stämme vorgeben.
Dieses Dokument hat nicht das Ziel, die morphologisch-basierte Identifizierung von Arten zu kopieren oder zu ersetzen. Das DNA-Barcoding wird vielmehr als ein ergänzendes Instrument zur Identifizierung vorgeschlagen, wenn die Morphologie keine schlüssigen Ergebnisse liefert oder für die Diagnose kryptischer Arten. Damit wird sichergestellt, dass die Ergebnisse verschiedener Ökotoxikologie-Labors sich auf die gleiche Art oder den gleichen Stamm beziehen.
Dieses Dokument ist anwendbar für die Identifizierung unreifer Formen ohne morphologische Diagnosemerkmale (Eier, Larven, Jugendstadium), sowie für die durchgängige Identifizierung von Proben, die in Feldüberwachungsstudien gesammelt wurden und bei denen zahlreiche Organismen unterschiedlicher Taxa klassifiziert werden.