This International Standard specifies a method for direct extraction of DNA from soil samples to analyse the
global structure and the abundance of soil bacterial communities using PCR-based technologies. This method
is mainly dedicated to agricultural and forest soils. This method can possibly not be suitable for soils rich in
organic matter (e.g. peat soils) or soils heavily polluted with organic pollutants or heavy metals.
The direct extraction of DNA from soil samples provides unique insight into the richness and structure of
microbial communities which are key parameters to estimate the biodiversity of soil microbiota. Molecular
approaches based on PCR (polymerase chain reaction) amplification of soil DNA constitute a promising
domain and can contribute in the near future to the development of routine tools to monitor the microbiota of
soil environments.
Users of the method ought to be aware that although soil submitted to the DNA extraction procedure is sieved
thoroughly (2 mm mesh, procedure described in 5.1), plant residues can still remain in soil samples and, as a
result, traces of plant DNA can contaminate the soil DNA extract.
Diese Norm legt ein Verfahren zur direkten Extraktion von DNA aus Bodenproben für die Analyse der allgemeinen Struktur und der Abundanz von Lebensgemeinschaften von Bodenbakterien mit Verfahrensweisen auf der Grundlage von PCR fest. Dieses Verfahren ist vorwiegend für landwirtschaftlich genutzte Böden und Waldboden vorgesehen. Dieses Verfahren kann möglicherweise für Böden mit hohem organischen Anteil (z. B. Torfböden) oder Böden, die stark mit organischen Verunreinigungen oder Schwermetallen belastet sind, geeignet sein.
Die direkte Extraktion von DNA aus Bodenproben bietet einen einzigartigen Einblick in den Artenreichtum und die Struktur mikrobieller Lebensgemeinschaften, was die Schlüsselparameter zur Abschätzung der Biodiver-sität der Bodenmikroflora und -fauna sind. Molekulare Verfahren auf der Grundlage der Amplifikation von Boden-DNA durch PCR (Polymerasekettenreaktion) stellen ein vielversprechendes Gebiet dar und können in naher Zukunft zur Entwicklung von Routinewerkzeugen beitragen, die die Abschätzung der Bodenbeschaf-fenheit ermöglichen.
Anwender dieser Norm sollten beachten, dass obwohl der Boden für die DNA-Extraktion sorgfältig gesiebt wird (2-mm-Sieb, Verfahren in 5.1 beschrieben), Pflanzenrückstände in den Bodenproben noch verbleiben können und damit Spuren von Pflanzen-DNA das Boden-Extrakt verunreinigen können.